Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnft1Q9DCN7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnft1Q9DCN7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms