Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Xab2Q9DCD2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms