Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fundc1Q9DB70 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fundc1Q9DB70 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms