Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB27

Mcts1, Malignant T-cell-amplified sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcts1Q9DB27 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Mcts1Q9DB27 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Mcts1Q9DB27 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Mcts1Q9DB27 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mcts1Q9DB27 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Mcts1Q9DB27 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Mcts1Q9DB27 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Mcts1Q9DB27 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Mcts1Q9DB27 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Mcts1Q9DB27 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Mcts1Q9DB27 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mcts1Q9DB27 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Mcts1Q9DB27 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Mcts1Q9DB27 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms