Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 695 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhobtb1Q9DAK3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhobtb1Q9DAK3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms