Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Y7

1700025F22Rik, RIKEN cDNA 1700025F22, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025F22RikQ9D9Y7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700025F22RikQ9D9Y7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms