Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt1Q9D9J3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt1Q9D9J3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms