Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp4bQ9D8B3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp4bQ9D8B3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chmp4bQ9D8B3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms