Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Chmp4cQ9D7F7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chmp4cQ9D7F7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms