Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc94Q9D6J3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc94Q9D6J3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms