Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn4Q9D6I3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms