Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spsb1Q9D5L7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Spsb1Q9D5L7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms