Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3a3Q9D554 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sf3a3Q9D554 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms