Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf1dQ9D4V4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf1dQ9D4V4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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