Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2al3Q9D4U4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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