Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcc1Q9D4H2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcc1Q9D4H2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcc1Q9D4H2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcc1Q9D4H2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcc1Q9D4H2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcc1Q9D4H2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms