Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4933428M09RikQ9D3X3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms