Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stag1Q9D3E6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag1Q9D3E6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms