Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D2Q3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D2Q3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D2Q3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D2Q3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D2Q3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D2Q3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D2Q3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q9D2Q3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q9D2Q3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D2Q3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms