Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pramef12Q9D2F1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pramef12Q9D2F1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms