Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms