Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lmbr1lQ9D1E5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lmbr1lQ9D1E5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms