Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3bQ9CZT8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms