Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR4

Cmtm8, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm8Q9CZR4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmtm8Q9CZR4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmtm8Q9CZR4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms