Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms