Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsfl1cQ9CZ44 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms