Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChtopQ9CY57 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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