Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mis12Q9CY25 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mis12Q9CY25 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Mis12Q9CY25 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mis12Q9CY25 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mis12Q9CY25 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mis12Q9CY25 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Mis12Q9CY25 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mis12Q9CY25 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mis12Q9CY25 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mis12Q9CY25 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mis12Q9CY25 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms