Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgo1Q9CXH7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Sgo1Q9CXH7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Sgo1Q9CXH7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Sgo1Q9CXH7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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