Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd4Q9CWX4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms