Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddx28Q9CWT6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms