Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NubplQ9CWD8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NubplQ9CWD8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms