Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atxn3Q9CVD2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn3Q9CVD2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms