Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrxn1Q9CS84 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms