Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9CR55 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9CR55 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9CR55 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9CR55 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CR55 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CR55 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CR55 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CR55 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CR55 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CR55 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CR55 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CR55 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CR55 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CR55 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CR55 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CR55 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CR55 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CR55 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CR55 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CR55 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9CR55 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9CR55 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9CR55 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CR55 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CR55 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CR55 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CR55 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CR55 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CR55 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CR55 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CR55 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CR55 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CR55 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CR55 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CR55 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CR55 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CR55 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CR55 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9CR55 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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