Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl28Q9CR40 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms