Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg12Q9CQY1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms