Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PompQ9CQT5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms