Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc2Q9CQP2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc2Q9CQP2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms