Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl35Q9CQL6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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