Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med4Q9CQA5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms