Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Ubl4bQ9CQ84 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ubl4bQ9CQ84 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ubl4bQ9CQ84 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ubl4bQ9CQ84 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ubl4bQ9CQ84 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ubl4bQ9CQ84 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ubl4bQ9CQ84 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ubl4bQ9CQ84 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ubl4bQ9CQ84 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ubl4bQ9CQ84 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ubl4bQ9CQ84 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms