Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudcd2Q9CQ48 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms