Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bhlhe41Q99PV5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhe41Q99PV5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms