Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf8Q99PV0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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