Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtn4Q99P72 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rtn4Q99P72 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms