Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab27bQ99P58 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rab27bQ99P58 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rab27bQ99P58 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rab27bQ99P58 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab27bQ99P58 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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