Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep41Q99NF3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep41Q99NF3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms