Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b1Q99NB9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms