Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ms4a4dQ99N05 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ms4a4dQ99N05 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4dQ99N05 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ms4a4dQ99N05 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ms4a4dQ99N05 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ms4a4dQ99N05 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ms4a4dQ99N05 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ms4a4dQ99N05 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4dQ99N05 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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